در ابتدای انقلاب، قرار بود ریاست قوه قضاییه به کدام مرجع تقلید واگذار شود؟
مسیح مهاجری در روزنامه جمهوری اسلامی نوشت: از بزرگان انقلاب در سال‌های اول بعد از پیروزی انقلاب اسلامی شنیدم که نظر این بود که اولین رئیس قوه قضائیه آیت‌الله سیدمحمدرضا گلپایگانی که از مراجع تقلید بود، باشد و دادستانی کل کشور را نیز آیت‌الله منتظری برعهده بگیرد.
به گزارش کیوسک تایمز و به نقل از خبرآنلاین، هرچند چنین خواسته‌ای عملاً قابل تحقق نبود ولی نشان‌دهنده نگاه کلان به مسائل حکومتی بود. درنهایت نیز امام خمینی اولین احکام ریاست قوه قضائیه و دادستانی کل کشور را به آیت‌الله بهشتی و آیت‌الله موسوی اردبیلی دادند که هردوی آن بزرگان مرجع بالقوه بودند و اگر آیت‌الله بهشتی در هفتم تیر ۱۳۶۰ به شهادت نرسیده بود، مثل آیت‌الله موسوی اردبیلی به مرجعیت می‌رسید. در انتصاب امام جمعه تهران و ائمه جمعه مراکز استان‌ها و نمایندگان خود در امور مختلف نیز امام خمینی با همین نگاه کلان عمل کردند و در مواجهه با مسائل کشور نیز توجه به اصول را محور کار خود قرار دادند و هرگز اسیر حاشیه‌پردازی‌ها نشدند و دیگران را نیز از پرداختن به مسائل فرعی برحذر می‌داشتند.